【PS3/ぷよぷよテトリス】セーブデータはソフト内から削除や初期化（クリア）ができるのか

ソフト内からはできません。
XMB(クロスメディアバー) > ゲーム > セーブデータ内から削除できます。

※インターネットプレイのデータは初期化できないものがございます。